菊花泡久了变绿是正常现象，主要是菊花茶中的黄酮类物质。正常情况下，黄酮类化合物是黄色的，但黄酮类化合物是活性的，不稳定的。泡好的菊花茶如果放久了，很容易被空气中的氧气氧化，氧化后会变绿，不是特别有害。
菊花中含有一种叫做类黄酮的营养元素，这也是人们认为喝茶有益健康的主要原因。黄酮类物质一般是黄色的，所以菊花茶泡的时候，黄酮类物质溶于水，菊花茶看起来是黄色的。
但黄酮类化合物具有活性，不稳定，容易被空气中的氧气氧化。而且氧化后会变绿，菊花自然会变绿。而且黄酮类化合物含量越高，越容易变色。
所以菊花茶冲泡一段时间后会变色。
影响菊花茶颜色变化的另一个因素与制茶用水有关。泡茶用水的酸碱度以及水中的金属离子也会影响菊花茶的颜色。
此外，武汉大学的研究人员发现，来自碱性水的菊花茶颜色偏黄；用酸性水浸泡过的菊花茶呈红橙色；含钙离子和铝离子较多的水，会与菊花中的黄酮类物质发生螯合反应，冲泡出来的颜色也不一样。
不同颜色的甘菊茶虽然不会变质，但是会对甘菊茶的抗氧化性能产生影响。如果短时间内(2小时内)泡出来的菊花茶变色，茶汤没有变质和异味，就可以喝了。
菊花茶汤如果放置时间较长，不建议饮用。一、菊花茶性寒，凉凉的茶汤不利于肠胃。二是长时间放置会沾染灰尘等不安全因素。
