普洱茶由于堆积发酵过程中微生物的参与，含有不同于红茶和绿茶的成分，主要表现在堆积发酵过程中茶多酚和儿茶素类化合物含量明显降低，茶黄素和茶红素含量低，氨基酸和糖含量降低，而且还形成许多特定的香气化合物。许多具有老化特性的香气成分，如壬醛、芳樟醇、芳樟醇氧化物、癸醇、1-乙基、2-甲酰基吡咯和苯乙醛，都有明显较高的含量。此外，没食子酸、1，2-二甲氧基-4-甲基苯、1，2-二甲氧基-4-乙基苯和1，2，3-三甲氧基-4-乙基苯的含量显著增加。因此，除了多酚类化合物和茶黄素外，普洱茶的二甲氧基和三甲氧基衍生物也是具有很强抗氧化作用的物质。刘教授认为普洱茶的抗氧化活性不是儿茶素的功能，而是二甲氧基苯类化合物的功能。事实上，可以说是两者的综合利用。早在清代，赵学敏(1765)就在《本草纲目拾遗》中记载了普洱茶对人体健康的影响：“普洱茶源于云南普洱地区。它尝起来苦，尝起来也苦。它能解除油腻的牛羊的毒素。弱者是被禁止的。苦中带苦，化痰降气，刮肠止泻。普洱茶膏黑如漆，先醒酒”。普洱茶的功效在短短的几个字里已经介绍得非常清楚了。普洱茶在以下几个方面对人体健康的影响最为显著：
1.降低血压和血脂：法国巴黎圣安东尼医学院的埃米尔卡罗比对40名高血压患者(男性13名，女性27名)进行了实验。服用普洱茶后，77%的患者甘油三酯含量下降，50%的患者胆固醇含量下降。日本、台湾、云南、西南农业大学等都进行了普洱茶降血脂的实验，并取得了积极的效果。
2.减肥：减肥的功能与降血脂密切相关。法国和日本科学家进行的实验证明，喝普洱茶和乌龙茶有明显的减肥效果。因此，普洱茶在国外被称为“减肥茶”和“瘦身茶”。
3.预防心血管疾病：长期服用普洱茶可以降低动脉粥样硬化，预防心血管疾病，因为普洱茶具有降血压、降血脂、降低血液粘度的作用。
4.辐射防护：根据广东中山大学何国范等人对普洱茶的研究结果，饮用2%的普洱茶汤可以减轻钴-60辐射的危害。
另一个需要特别指出的问题是普洱茶是否对人体有害。首先，普洱茶有毒吗？其次，微生物参与普洱茶的堆积发酵。会有有害微生物吗？关于毒性问题，西南农业大学刘教授(2003)最近报道了用普洱茶汤对小鼠进行急性毒性实验。结果表明，供试普洱茶产品对小鼠的中位致死剂量为9.7-12.2克/千克。这相当于一个体重50公斤的人需要服用485-610克普洱茶一次才能中毒死亡，这几乎是不可能的。关于有害微生物(如黄曲霉)的有无，根据台湾大学孙鲁喜教授(2003)的报告，她在普洱茶的模拟堆发酵过程中接种了黄曲霉，没有检测到黄曲霉，因为普洱茶的堆发酵过程中存在各种无害酵母，具有优势，黄曲霉不能存活和繁殖。堆积发酵普洱茶消毒后，接种黄曲霉。由于没有优势酵母菌种，黄曲霉可以微量生长(1.05g/kg)，但低于卫生标准。
