铁观音在安溪民间一直被用来治疗痢疾和胃痛。中国古代医书中也有许多记载，茶用于治疗细菌性痢疾、红色痢疾、白色痢疾、急性肠炎和急性胃炎。
铁观音主要由茶多酚化合物组成。由于茶多酚进入胃肠道，它可以放松肠道的神经功能，缓解肠道运动。同时，它还能凝结肠道蛋白质，因为细菌本身是由蛋白质组成的。茶多酚与细菌蛋白相遇时，细菌会死亡，起到保护胃肠粘膜的作用，从而具有治疗肠炎的作用。
铁观音不仅香醇，而且是一种天然美味的饮品，其保健功能也是茶中的佼佼者。现代医学研究表明，铁观音不仅具有普通茶的保健功能，还具有抗衰老、抗癌、抗动脉硬化、防治糖尿病、减肥、健美、防治龋齿、清热降火、戒烟醒酒的功效。
